Molekyler i 3D
Tack vare den snabba datorutvecklingen kan även du och jag få en egen virtuell molekyllåda. Med hjälp av ett insticksprogram till din webbläsare kan du studera molekylerna som finns i boken på riktigt nära håll. Du kan antingen ladda hem molekyler direkt från nätet eller tillverka själv via ett par olika webbtjänster. Följ med så visar jag hur det går till.1. Klicka här så kommer du till Paralell Graphics sida där du kan ladda ner Cortona VRML client. Klicka på Install Cortona VRML Client 4.2. Din webbläsare undersöks. (Macintosh använadre hittar länken i högermarginalen.)
2. Du får nu två alternativ: Install now! eller Manual setup. Jag rekommenderar att du först provar Install now! och om det inte fungerar använder du Manual setup. Programmet fungerar i Internet explorer och Firefox, t o m till Opera, men det har jag inte provat. Ett litet hinder finns dock. Du måste tillåta att programmet installeras. I Firefox klickar du på listen precis ovanför ramen.
3. När du ser en roterande kub i webbläsarens fönster så är installationen klar.
Var får jag tag i molekylerna?
4. Nu beger vi oss till den här adressen:
VRML File Creator for Chemical StructuresKlicka på Start editor. Då öppnas ett molekylverktyg i ett nytt fönster. Låt oss tilvverka en ammoniakmolekyl (NH3). Klicka på kväveatomen (N) till vänster och därefter klickar du på arbetsytan. Nu ska ett blått N synas på skärmen. Om man inte anger något annat så lägger programmet själv till de tre väteatomerna som saknas. Så nu var vi faktiskt redan klara. Klicka på Transfer.
5. Vi hamnar åter igen på startsidan. Nu har ett N fyllts i rutan till vänster om Start editor. Vi ändrar inte i nuläget på några inställningar utan markerar Yes och klickar på Submit längst ner på sidan.
6. Vår molekyl skapas. Högerklicka och välj Spara mål som (Internet explorer) Spara länk som (Firefox). Döp filen och välj var du vill spara molekylen, t ex på Skrivbordet som ammoniak.wrl. Det är viktigt att filen också efter att du döpt den slutar med ändelsen wrl.
7. Leta upp filen och klicka på den. Webbläsaren och filen öppnas, men om du har Servicepack 2 installerat så blockeras tyvärr filen. Klicka på den gula listen ovanför ramen och välj Tillåt innehåll som blockeras. Nu visas molekylen i webbläsaren! 8. Se till så att turn är markerad i listan till vänster. Med hjälp av musen kan du vrida, vända och zooma in moloekylen. Håll nere vänster musknapp och dra pilen över molekylen. Nu roterar molekylen åt det håll som du för musen. Prova – upp, ner, vänster och höger.
Om du håller nere vänster musknapp och för musen uppåt så zoomar du in molekylen.
Om du klickar på pan, håller vänster musknapp intryckt och för musen i sidled panoreras molekylen.
Laborera gärna lite på egen hand. Du kan alltid återgå till utgångsläget genom att klicka på restore.
9. Redo för en ny molekyl, men i ett annat format och ett annat program?
Här kan du installera Chime. Programmet har fler möjligheter än Cortona men klarar inte av VMRL, utan vi får förlita oss till PDB och MOL. Du hittar en rad MOL-filer i den här databasen.
Du kan också tillverka egna MOL-molekyler med Chemsketsch.
|